Program Studi Magister Kesehatan Lingkungan adalah salah satu program studi magister ketiga di Indonnesia dan merupakan program studi magister keenam yang dikelola oleh Fakultas Kesehatan Masyarakat, Universitas Hasanuddin (Unhas). Program studi ini berdiri pada tahun 2022 berdasarkan Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan dan Kebudayaan saat itu (Kementerian Pendidikan Nasional saat ini) bernomor 115/DIKTI/Kep/1999 tertanggal 5 Maret 1999, tentang Pembentukan Program Magister Kesehatan Lingkungan pada Program Pascasarjana di Lingkungan Universitas Hasanuddin Makassar. Program studi ini berada di Kampus Unhas Tamalanrea Jl. Perintis Kemerdekaan Km.10 Makassar. Sejak tanggal 29 Agustus 2022 berdasarkan Surat Keputusan Rektor No. 5685/UN4.1/KEP /2022- Tentang Izin Pembukaan Program Studi Magister Kesehatan Lingkungan Universitas Hasanuddin, program studi Magister Kesehatan Lingkungan saat ini ber Akreditasi Minimum Baik.

Sesuai dengan visi Universitas Hasanuddin dan FKM Unhas yang berbasis Benua Maritim Indonesia, keunggulan dan karakteristik Program Studi Magister Kesehatan Lingkungan Unhas dapat dilihat dari pengembangan keilmuan yang disesuaikan dengan karakteristik daerah dan local specific kawasan timur Indonesia dengan memahami budaya yang beragam dan cross culture.Program Studi Kesehatan Lingkungan FKM Unhas akan memfokuskan diri pada pengembangan keilmuan yang berbasis wilayah pesisir dan kepulauan sebagai keunikan dan keunggulannya.Konsep Benua Maritim memandang wilayah Nusantara dan bangsa Indonesia yang memiliki beragam suku, etnik, budaya, agama, dan golongan menjadi satu kesatuan. Ini berarti kajian kesehatan lingkungan yang bertujuan untuk pemecahan masalah-masalah kesehatan lingkungan dan pengembangan kesehatan masyarakat wilayah pesisir dan kepulauan akan menjadi fokus Program Studi Kesling FKM Unhas kedepannya.